Hola:
El popup se relaciona con la ventana "abridora" mediante el objeto opener.
Yo recomiendo valerse de una función en la ventana principal que reciba el valor como parámetro:
página principal:
<script>
function actualizar(dato) {
document.forms.f.texto.value = dato;
}
</script>
...
<form name="f" ...>
<input type="text" name="texto" />
</form>
popup:
opener.actualizar("nuevo texto");
Saludos