Como centrar un elemento con Javascript

[alvarols]

Estoy por implementar un pop-up (todavía estamos analizando si hacerlo con jQuery o con Javascript Puro) donde aparecería un video. Quiero que este pop up con el video quede centrado verticalmente (horizontalmente se puede hacer con css) para cualquier resolución de pantalla. ¿Alguien sabe como lo puedo lograr con Javascript?

[ocp001a]

Tomando la altura del navegador disponible, restando el tamaño del popup y dividiendo entre dos.

Código Javascript:

function alto_pantalla(){
    if (navigator.appName.indexOf('Explorer') != -1)
        return document.body.parentNode.scrollHeight;
    else
        return window.innerHeight;
}
 

[alvarols]

Muchas gracias