Si que puedes lanzar la carga de dos DIV al mismo tiempo, para ello tienes que llamar a cada objeto de una forma distinta. Yo hago lo siguiente:
   Código PHP:
    function cargarContenido(div){             
        eval("var contenedor_"+div+"=document.getElementById('contenedor_"+div+"');");                
        eval("var objeto_"+div+"=nuevoAjax();");                
        eval('objeto_'+div+'.open("POST", "includes/procesos.php",true);');
        eval('objeto_'+div+'.setRequestHeader("Content-Type", "application/x-www-form-urlencoded");');
        eval('objeto_'+div+'.send("tabla='+div+'&valor='+d1+'");');                
        eval('objeto_'+div+'.onreadystatechange=function(){ if (objeto_'+div+'.readyState==4) { contenedor_'+div+'.innerHTML = objeto_'+div+'.responseText; } else {contenedor_'+div+'.innerHTML = "<img src=\'ajaxloader.gif\'>";}; } '); 
    
  Yo cargo simultaneamente 7 u 8 combos (DIVs) y me funciona a la perfección. 
Ni ke decir tiene ke tendras ke llamar dos veces la funcion, una llamada por cada div 
 Código PHP:
    <input type="button" onClick="cargarContenido('primer_div'); cargarContenido('segundo_div');"> 
    
  Espero ke te sirva.
salu2.