Hola.
En primera debes fijrte que la hayas colocado bien y si es la pila correcta y fíjate que tenga el voltaje necesario, tal vez sea una pila vieja y ya no funcione, también haz la prueba sacándola de nuevo y volviendola a poner, trata de resetear el BIOS con el jumper que viene casi junto a la pila (tiene la forma de un rectangulito que se puede quitar, o consulta el manual de la MoBo), también fíjate que los cables de la fuente y del HDD esten bien anclados en sus respectivos lugares.
Tal vez sea la fuente, chécala con un multímetro si puedes.
Suerte.