Jpinedo, nunca se me presento un problema asi, sino que ahce tiempo estuve laburando en un cd (con proyector.exe, como tu dices) y lo adapte en principio para 800x600 (osea ese era el tamaño del documento), luego le di que haga fullscreen, pero para que no se deformen y pixelen las fotos y demas le meti el comando allowscale como "false" para que solo el fondo de la aplicacion haga el full screen y todo quede a 800x600 centrado, entonces tanto los usuarios con esa resolucion como los que veian la aplicacion con 1024x768 podian navegar la aplicacion sin problemas.
Pero tu problema es inverso, si es que entendi bien no?
Perdon que no te pueda ayudar en tu caso, pero ya sabes para la proxima que si quieres presentar algo accesible para las dos resoluciones: diseñas para 800x600 y luego con el allowscale y el fullscreen lo adaptas a 1024.
Para usar el allowscale
en este post lo explico.
Espero que algo de todo esto te sirva y soluciones eso.
Saludos.