Hola
Si no he entendido mal, l oque quieres, es que cuando un usuario haga clic en un vínculo, se descargue algún programa o archivo ¿cierto?
Esto es sencillo, basta con que así lo indicques en el vínculo:
Ejemplo
Código:
<a href="archivos/programita.zip">Descarga del software «programita» en un archivo comprimido</a>
Este típo de vínculos, le presentará al usuario la típica ventana de descarga de archivos.
Felicidad