Si tienes complicaciones con consultas complejas utiliza la variable $_pagi_conteo_alternativo que para eso fue creada. Bastará con que la pongas en la parte de inicialización de variables (antes del "include()"). Por defecto está en "false", así que deberás poner esta línea:
Código PHP:
$_pagi_conteo_alternativo = true;
Ojalá con eso se resuelva tu problema. Si no se resuelve, te agradecería que me contactaras por email para ver más detalladamente el problema.
Saludos