mmmhhh
el hecho que has dejado como dominio solo "empresa" sin el .com en lo personal, yo no lo haria, si no piensas utilizar el dominio en futuro para abrirlo al exterior dejalo mejor como empresa.local
ahorita que estas comenzando a configurarlo puedes quitar el dcpromo.exe y comenzar desde el inicio
el windows 2003 es un poco diferente en lo que respecta al dcpromo.exe ya que no es tan facil configurar despues el DNS... lo mejor es configurar primero el DNS antes de instalar el dcpromo.
otra cosa que debes tener en cuenta... actualmente has dicho que tus clientes trabajan en local, si lo quieres meter en dominio, no necesitas crear los objetos computer en users and computers ya que se crean por default cuando los metes al dominio.
si deseas que luego tus clientes (users) hagan el login al dominio y no en local) se creara un nuevo desktop asi que luego deberas copiar los accesos directos, correo, documentos ect. al nuevo desktop.
dentro de users and computers debes crear los usuarios dentro de grupo users domain y despues que hayan hecho el login a tu dominio y se haya creado su nuevo desktop entonces puedes borrar el account local donde tienen privilegios administrativos. (obvio primero copias todo antes de borrarlo)