una opcion muy util que a mi me ha funcionado es el viejo y conocido FDISK de DOS... puedes preparar tu disco duro con el (borrar particiones, crearlas) y al final solo te dedicas a instalar con tu disco de Win XP Pro
si no mal recuerdo no sera necesario formatear la particion despues de crearla con el fdisk, ya que el instalador de xp lo hara...
por cierto el fdisk te reconoce las particiones NTFS como particiones NO DOS...
Espero haber sido de ayuda
Me acabo de registrar... esta es mi primer respuesta