Lo mejor es que hagas la instalacion directamente desde los rpm que de seguro para tu distribucion los paquetes ya estan listos para lo que necesitas...
Yo recomiendo que quites todo rastro de los paquetes instalados tanto por rpm como los que intentaste compilar, si es necesario reinstala Linux, Bueno ahora regular mente en las distribuciones vienen paquetes por este estilo
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php
mysql
php-mysql
apache
apache-modphp
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Se pueden llamar diferente segun tu distribucion
Instala cada uno de ellos y no tendras necesidad de compilar aplicaciones y el servidor te quedara con todo listo...
Otra opcion hay un proyecto de apache muy bueno que se llama
xamp existe tanto para linux como para windows... la verda no lo he probado en Linux pero ha de funcionar...y es perfecto para lo que necesitas....
Otra opcion ...distribuciones como Mandrake... RedHat Y otras ya tienen estos paquetes por defecto no hay que compilar ni configurar nada...