El sistema de actualización por defecto en Fedora 3 es yum. El funcionamiento es muy similar al de apt:
Puedes configurar los repositorios en /etc/yum.conf, o en archivos individuales en /etc/yum.conf.d
De todas maneras, si quieres usar apt en Fedora, puedes bajarlo (junto con una enorme cantidad de programas adicionales) desde
http://freshrpms.net