Tienes que usar un script a parte de tu HTML para generar tu gráfico y llamarlo desde HTML en un tag de imagen común tipo:
<img src="script_genera_grafico.php">
Y tu script_genera_grafico.php contendrá tu actual código que genera dicho gráfico ... si necesitas pasar algún parámetro a ese "script" .. usa el URL tipo:
script_genera_grafico.php?parametro=valor
Un saludo,