Hola, Drulin
Bienvenido a los foros.
Creo que lo mejor será que conviertas las comas a puntos, para poderlos evaluar como números. El punto de los miles hay que quitarlo. A ver si me sale:
Código PHP:
function ordena(d1,d2)
{
d1 = d1.replace(".","")
d1 = d1.replace(",",".")
d1 = parseFloat(d1)
d2 = d2.replace(".","")
d2 = d2.replace(",",".")
d2 = parseFloat(d2)
if (d1>d2) alert("El mayor es "+d1)
else alert("El mayor es "+d2)
}
Creo que con eso te valdrá.