Hola,
Cita: cd $SOURCE
tar cf - ems/ | (cd $TARGET; tar xf -)
El primer "tar cf - ems/" archiva el contenido de la carpeta ems, después utiliza un "pipe: |" que en sencillas palabras, sirve para enviar la salida de un comando a la entrada de otro, en este caso el archivo tar que acabas de generar lo envias al siguiente comando, donde primero cambia de ubicación al directorio $TARGET y después con el "tar xf -" extrae el contenido del archivo tar que se generó al inicio en el directorio destino.
Espero haber sido claro y no revolverte más.
Saludos,