Via COM (
www.php.net/com .. lo cual fuerza a que uses PHP bajo windows) puedes generar un formato .doc .. en su defecto tendrás que generar RTF (Ritch text format) que también lo lee Word y lo interpreta (con tipografías y demás) ..
En PHP lo más común es generar un PDF dinámico con classes como R&OS o FPDF .. además de ser el PDF un formato "portable" entre diferentes plataformas no te limita a usar PHP bajo Windows o Linux como servidor .. funciona desde cualquier S.O. del servidor.
Un saludo,