es facil y sencillo, de echo mira por ejemplo diagmos que tu sitio lo registrastes con el nombre
www.patito.net entonces si quieres crear una nueva cuenta de hosting con el WHM es sencillo creas la cuenta y en donde te pide nombre de dominio pones el subdominio
www.nombreweb.patito.net y las demas pciones claro. o si te refieres que una cuenta con dominio
www.patito.net cree un subdominio pues es facil primero bueno depende que que l paquete que hicistes tenga la cuenta habilitada para crear subdominios, al igual en las opciones de paneles en tu gestor de apaiencia hallas puesto la opcion habilitad de crear. si ya tienes eso es facil primero creas el subdominio. despues tienes 2 opciones 1.- utililzar el subdominio para redirigirlo a una url de tu web o si quieres cuando se crea e subdominio automaticamente crea una carpeta con el nombre del subdominio y lo puedes utilizar como otra pagina, y si quieres que un usuario maneja ese subdominio con una cuenat ftp, solamente creas la cuenta ftp con el nombre del subdominio que creastes y listo.
jejej espero no haberte revuelto