Cuando Cierro Un Mdi Queda En Memoria...

[Dans]

Mira te recomiendo que te asegures de cerrar todos tus formularios.
¿Como te aseguras de ello? Pues crea una funcion que cierre todos los formularios activos (menos el mdi) y la llamas en el evento Unload del MDI.
Y de ser así puedes asegurarte de que se termine tu aplicación con lo siguiente.

Private Sub MDIForm_Unload(Cancel As Integer)
End
Set MDIForm1 = Nothing
End Sub

A mi esto me funciono en una ocasion que me sucedio tu problema.