Bookmarks = Marcadores
es argot de Netscape, heredado por Mozilla
Es equivalente a los "Favoritos" de IE
Mozilla te deja ponerla en un panel lateral, pero me temo que javascript no esté preparado para tales idiosincrasias.
De todos modos, juanito, ¿crees que el usuario pretenderá abrir SUS marcadores cuando navegue por TU página?
Por otro lado ¿has probado a abrir la ventana sin argumentos? Eso suele resultar en la ventana por defecto del navegador, que quizás permita el panel de marcadores
Es decir:
window.open('miventana.htm', 'elnombre');
simplemente.
