... Bueno, insisto, temo que yo no he usado Nuke así que no podré ayudarte en ese aspecto... Tengo entendido el Nuke tiene un formato clásico (cabecera, dos columnas a los lados y en la parte central el contenido) y con diseños ya fabricados.. descargables desde sitios solo para instalar y darle un nuevo aspecto... Entiendo que tú ya tienes tu diseño... supongo Nuke usa Templates y es totalmente configurable...
Me pregunto ¿ya lo tienes instalado?, ¿tienes conocimientos de PHP?.. ¿Haz intentado algo?
Te sugiero qué mejor preguntes en el subforo de Aplicaciones prefabricadas... quiero suponer allá podrán ayudarte mejor... y más rápido si tienes dudas específicas... vaya, igual te sugiero instalar el Nuke (si no lo haz echo), observarlo.. tratar de entenderlo...
Sitios que te pueden servir:
http://www.forosdelweb.com/f54/ << El subforo de aplicaciones prefabricadas. Checa las FAQ.
www.phpnuke-espanol.org www.phpnuke-hispano.com www.desarrollonuke.org www.google.com <<
Lamento que no te pueda ayudar en más... Suerte!

... dejame saber cómo vaz evolucionando con el tema