O puedes hacerlo directamente desde PHP.
Utilizando la funcion chmod()
http://ar2.php.net/chmod Código PHP:
<?php
if( chmod("archuvo.tuyo", "0777") ) {
echo "Permisos cambiados";
} else {
echo "Error al cambiar permisos";
}
?>
Otra cosita... No puedes especificar en el nombre del archivo una direccion url o un archivo de otro servidor. Debes poner la direccion real.
Saludos!