Archivo click.php
Código PHP:
<?php
//aca pone la conexion a tu base de datos
$sql = mysql_query("SELECT * FROM nombre_tabla WHERE id = '$_GET[id]'");
if($row=mysql_fetch_array($sql)){
$url=$row[url];
$clicks=$row[clicks]; //aca tomamos cuantos clicks tiene la DB, pone que por defecto sea cero (0)...
}
//aca hacemos el update..
$clicks=$clicks+1;
mysql_query("UPDATE nombre_tabla SET clicks = '$clicks' WHERE id = '$_GET[id]'");
//aca reenvias a la pagina verdadera
echo '<META HTTP-EQUIV="Refresh" content = "0; URL='.$url.'">'; //esto tambien lo podes hacer con header()
?>
Al banner tenes que ponerle url del tipo
http://tudominio.com/click.php?id=1, en donde 1 tiene que cambiar por el id de ese banner...