Mira, me va a ser difícil ayudarte ya que no se como creaste tus particiones con esa aplicación del disk manager. Yo solo lo he usado para cuando el BIOS no me reconoce HD grandes.
Si estas experimentando, yo te recomendaría hacer las particiones con FDISK
http://protegepc.fateback.com/xfdisk.htm
Pero si lo ves complicado, podrías usar una herramienta gratuita la cual he escuchado que es buena pero NO la he usado pero se ve fácil, se llama
Ranish Partition Magic.
Asegurate de crear UNA SOLA PARTICION PRIMARIA (50 Megas), luego el resto del HD como partición extendida y dentro de la extendida, creas las unidades lógicas para D: 6900MB WIND98SE, E: 6900MB WIN2000 y F: 6900MB WIN XP.
NO te pongas a hacer más de una partición primaria.
Esa es la forma que te recomendé antes de como lo he hecho por varios años, formateando, eliminando, volviendo a formatear y siempre funcionando.