Bueno no recuerdo muy bien como era poco estoy volviendo a meterme con el tema WEB, pero o te falta "/" antes del nombre de la carpeta:
<A HREF="/descargas/banderas.rar">banderas</a>
o le tienes que poner la URL completa:
<A HREF="http://midominio.com/descargas/banderas.rar">banderas</a>
Salu2