Holas otra vez,
vamos a ver,
Yo no creo mi base de datos directamente desde el phpmyadmin.
Utilizo un programa llamado case studio2 . Con esto puedo hacer un diagrama entidad-relacion facilmente, y lo puedo hacer asignandole el tipo de base de datos a diseñar (hay mysql 4.0 y 4.1). Alli creo todo lo que necesita mi base de datos (incluido claves foraneas). Una vez hecho el diseño , permite exportarlo a .sql y luego tu puedes ejecutarlo en tu phpmyadmin. El programa esta en la version 2.18(es trial pero puedes piratearla con un patch de la 2.17 facilmente).
Si lo deseas, puedes bajartelo en :
http://www.casestudio.com/enu/default.aspx
tambien puedes bajarte la documentacion en .pdf.
No se, es lo que puedo ofrecerte en forma de ayuda
abe_k