Por poder puede ser, no te lo aseguro... Desinstala ese pack, reinicia, y te instalas los codec básicos por separado:
http://codecs.mundodivx.org
Luego configuras el tmpgenc como se dice aquí:
www.mundodivx.com/mpeg/tmpgenc.php?p=2
Cruza los dedos y prueba...
De todas formas si el error fuera de codecs, debería suceder antes del final.
Se me ocurre otra cosa. Si estás creándote un M2V y éste supera los 4 GB de tamaño, asegurate de tener el disco duro formateado como NTFS y no como FAT32, ya que este último tiene un límite de 4 GB por archivo.
Saludos