La sintaxis de PHP es un poco más sencilla que la de JSP (que es código Java) , sin embargo, que haya mas páginas PHP que JSP, no significa que sea mejor, la razon principal por la cual es más popular son los costos que el desarrollo y la aruitectura implica.
Sin embargo, la mayoría de aplicaciones web grandes del negocio, robustas, seguras, escalables, alta disponibilidad y de fácil integración con otros sistemas, son hechos con JAVA, aplicando para la parte web las tecnologías de J2EE: JSP, Servlets, JavaBeans, ...