lectura de a dos lineas.. o lineas pares

[goncafa]

Pues tu error esta aqui

Código PHP:

  while(in_arch.readLine()!=null){
    archLine = in_arch.readLine();
    System.out.println ("file-->"+archLine);
} 
   

pues priemro lees en wl while, y luego haces otra lectura, por tanto, pasa a la linea siguiente, tu codigo deberia ser solo asi

Código PHP:

  while(in_arch.readLine()!=null){
    System.out.println ("file-->"+archLine);
} 
   

Saludos