Hola
Juanchooo
Eso depende de la configuración del usuario. Si tiene un programa definido para abrir determinado tipo de archivos, se abrirán sin preguntar. La solución es comprimirlos y entonces si que preguntará si quierer abrirlo o guardarlo. No se si con algún lenguaje de programación podría hacerse algo, desde luego con JavaScript no se puede.
Saludos,