¿Has leido algo sobre hdparm?
Cita: El comando hdparm permite visualizar y modificar los parametros del disco duro para los discos IDE en Linux, de forma que es posible mejorar el rendimiento obtenido con los mismos. Aunque hay que tener una cierta precaución y cuidado, puesto que al ser tan potente implica también ciertos riesgos, aunque si sabemos en cada momento lo que estamos haciendo no hay ningún problema: "Playing with "disk options" could cause corruption with your filesystem so back it up first." ...
Mirá por aquí:
http://bulma.net/body.phtml?nIdNoticia=1210
De todos modos, creo que para lo que pides, JFS sería la mejor opción.