Hola!
Yo hace poco tuve el mismo problema con la clase FPDF y las sessions. Como dice Cluster, se soluciona con el session_cache_limiter() pero debes pasar como parametro "none".
Algo como esto:
Código:
<?
session_cache_limiter('none');
?>
Al menos asi, a mi se me solucionaron esos problemas.
Espero te sirva, un saludo