Hola
Bueno, empecemos, trata de escribir un poco más claro, tanto en la ortografía, como en la descripción de tu problema.
En principio, por lo que comentas, el template que tienes tendrá tablas y demás, la mejor manera de que coloques los frames, es que uses etiquetas <div> y en ellos los iframes. Es posible que puedas prescindir de los div y colocar directamente los iframes.
Pero claro, deberás hacer pruebas a ver como va la cosa.
SUerte
Felicidad