Hola Andariel,
A ver... el tema es que una ventana "pop-up" es justamente pop-up si la abres desde una ventana normal.
Si colocas un enlace "normal" tipo: <a href="http://www.miserver.com/pagina.htm">Abrir</a> no será una ventana "pop-up" nunca. Jamás podrás asignarle los mismo atributos que a un pop-up.
Lo único que podrás hacer es:
- Modificar su tamaño
- Eliminar las barras de scroll
Tal vez, la mejor solución sea la siguiente:
- Envías al usuario a una página abriendo un enlace normalmente
- En la página a la cual lo envías, abres la pop-up automáticamente
Con un poco de imaginación podrás hacer que la página inicial no quede en blanco como si tuviese algún error. Puedes colocarle una imagen de carga rápida, un texto que indique lo que está sucediendo o agradezca la visita al usuario, etc.