yo tambien tuve un problema similar al tuyo, de hecho el java script no es tu problema.
prueba esto a ver si te srive.
tu debes tener declarado tu script de la siguiente manera: <script "javascript">
codigo script
.
.
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</script>
solo tienes que hacerlo asi:
<script>
codigo script
.
.
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</script>
yo hice esto y me funciono, quiza a ti tambien te pueda ayudar.
saludos.