Deberías pensar en otro método donde tengas un control más fácil de las variables. Por ejemplo, generar dinámicamente el número de campos del formulario según la cantidad de registros que quieras insertar. Pero yo sigo sin verle mayor objeción a insertarlos uno por uno.... te hace todo más claro y fácil.
De todos modos, si quieres hacerlo como dices... cada vez que haces un salto de línea se escribe el caracter "\n" (o \r, \rn, según)... lo que tendrás que hacer es buscar ese caracter en el texto y separar las porciones de cadena que hay entre esos caracteres. Para eso puedes utilizar la función explode(). (busca en el manual de PHP esa función... no hay nada como el manual)
Saludos