como crear un instalador

[goncafa]

Pero realemente tu aplicacion necesita meterse a los registros del sistema operativo??
Lo ams cencillo es empaquetar toda tu aplicacion en un solo JAR, dentro de este podrias meter tantos JAR como quieras, por ultimo, puedes crear un ZIP con toda la aplicacion, recordemos que en un ZIP puedes meter tanto archivos como carepetas, y luego al descomprimirla, esta respeta todo, y podrias tener toda la aplicacion, independientede cuantas carpetas tengas dentro, dentro de una solo carpeta, seria lgo como los RPM de linux.

Saludos