hola haven
Si te he entendido bien esto es lo que quiere hacer.
function disparaPopUp(str){
var regBr1 = /^\s+|\s+$/g
var regBr2 = /\n/g
//Eliminamos los espacios a ambos lados de la cadena y añadimos
// las etiquetas <br>
str = str.replace(regBr1,"").replace(regBr2,"<br>")
MM_openBrWindow("lateral.asp?Prm="+ str,"archivos","width=350,height=550")
//open("popup.htm?Prm=" + str);
}
Espero que te sirva.
Un saludo