Hola José Molina.
El select:
<select name="select" onchange="mostrar(this.value)">
<option value="0" selected>Seleccione</option>
<option value="1">Instituciones</option>
<option value="2">Médicos</option>
</select>
y la función:
function mostrar(cual){
if(cual==0) return;
cual='Layer'+cual;
var misCapitas = new Array('Layer1','Layer2')
...
Espero que te sirva. Saludos,
