kernel 2.6.9

[Dark Link]

Si lo hiciste con fuentes oficiales de Debian no deberia ocurrir errores. ¿Usaste backports en woody?, podria ser un problema, ya que los backports instalan cosas nuevas, Sarge no tiene los paquetes mas nuevos.
Puedes usar el comando

apt-get -f install (asi como esta, no pongas nombres de paquetes)

Con este te dira si necesitas instalar, eliminar o upgradear algun paquete, ese comando me ha salvado infinidad de veces, sobretodo cuando me paso de listo usando el APT (se vuelve un vicio -_-).

Ya que estas en Sarge y quieres dar una miradita al kernel 2.6, puedes instalar una imagen del kernel hecha por Debian, supongamos que tienes una 686:

apt-get install kernel-image-2.6.7-1-686

Si no tienes una 686, haz una apt-cache search kernel-image-2.6 y saldran las imagenes diseñadas para distintas arquitecturas.

Postea aqui los errores que te marca el apt.
Suerte

P.D.: Cuando instalaba imagenes de kernel con LILO me provocaba errores, asi que lo quite y en su lugar instale GRUB, ya que con este es mas facil de modificar, tambien se agrega a gnome y se puede editar el arranque con un programa. Si quieres quitar lilo y no sabes, me avisas.