Yo tengo instalado apache y todo eso y cuando instalé el SP2 no tuve que cambiar nada... quizá me dio el aviso del firewall de si deseaba permitir a apache acceder a la conexión o algo así, pero no recuerdo si me dio ese aviso o no
Por incompatibilidad por tanto no es, yo tengo instaladas las últimas versiones de apache 2.X, php y mysql.
Saludos