Hola 
Bueno, primeramente cual Versión tienes de Apache. Las verciones que conosco que caminan sobre Windows ninguna se le queda la ventana de MSDOS abierta. Se le queda abierta cuando tiene un Error o algo parecido.
Tambien debes de ver como lo enciendes:
Inicio - Apache HTTP Server - Control Apache Server - Start
Saludos
