Hola... pues yo usé para realizar mi tesis sobre una página web los casos de uso y los diagramas de clases usando esta metodología que encontre en Internet...
http://www.software-engineer.org/dow...s%20with%20UML está en inglés pero si conoces de UML te será fácil aplicarlo.
Si quieres un manual de UML en español puedes verlo aqui
http://www.vico.org/UMLguiaVisualpresentacion.htm
Además el Rational Rose creo que ya implementa UML orientado a web... si quieres bájalo y usas el trial de 30 dias.
saludos!