VMWare es una máquina virtual que permite a un sistema operativo correr dentro de otro sistema operativo. Es software comercial (tienes que pagar por él), pero te dan una versión de prueba de 60 días (creo).
En todo caso, si realmente necesitas Win98 (u otro), lo mejor es que... instales Win98
No es pecado tener 2 S.O. instalados en tu PC. Yo tengo Win98 porque mi escaner no funciona en Linux