Primeor que nada, J2EE no se instala sobre IIS, sino que IIS se configura para conectarse con J2EE, para istalar J2EE solo bajalo (es gratuito) y lo instalas en tu maquina, ya tendras tu J2EE, ahora, si quieres que tu IIS sirva por ejemplo páginas JSP/Servlets y cosas por el estilo entonces debes configurar tu IIS para que se comunique con tu J2EE, para eso lo mejro es googlear un rato, luego de algunas busquedas encontraras lo que necesites y solo te vastara con seguir los pasos
Saludos