yo haría lo siguiente tablas dentro de tablas.
Código HTML:
<table> //Tabla de 1 fila por tres columnas
<tr>
<td>
<table> //Tabla de 2 filas por una columna
<tr>
<td>
</td>
</tr>
<tr>
<td>
</td>
</tr>
</table>
</td>
<td>
<table> //Tabla de 2 filas por una columna
<tr>
<td>
</td>
</tr>
<tr>
<td>
</td>
</tr>
</table>
</td>
<td>
<table> //Tabla de 2 filas por una columna
<tr>
<td>
</td>
</tr>
<tr>
<td>
</td>
</tr>
</table>
</td>
</tr>
</table>
en ese caso... las tres columnas serían totalmente independientes una de otra...
saludos!