Hola otra vez:
Por lo que veo, solo te queda usar el "ajuste"...
En vez de:
document.getElementById('segundos').firstChild.nod eValue = segundero;
debes usar:
document.getElementById('segundos').firstChild.nod eValue = ajuste(segundero);
y lo mismo para el minutero y el horario.
Supongo que con eso será suficiente.
Saludos