pues sí el "wmode" es sólo para IE, para los parientes de Netscape tienes que usar el parametro "bgcolor"
ejemplo
Código HTML:
<div id="movie" style="position:absolute; top:82px; width:760; height:100px; z-index:1; left: 12px;">
<object classid="clsid:D27CDB6E-AE6D-11cf-96B8-444553540000" codebase="http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=6,0,29,0" width="760" height="100">
<param name="movie" value="tu_pelicula.swf">
<param name="quality" value="high">
<param name="wmode" value="transparent">
<param name="bgcolor" value="transparent">
<!-- wmode es para IE y bgcolor es para netscape -->
<embed src="tu_pelicula.swf" width="760" height="100" quality="high" pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer" type="application/x-shockwave-flash" wmode="transparent" bgcolor="transparent"></embed>
</object>
</div>
si trabajas con el dreamvear este te coloca bastante código extra, pero no te asustes, te tienes que fijar en que están los parámetros "wmode" y "bgcolor".
salu2