La mayoríia de las distribuciones traen algún asistente para configurar el entorno gráfico. Busca en google cuál es la que usa tu distro.
Si no, vas a tener que editar a mano el archivo /etc/X11/XF86config (o /etc/X11/xorg.conf en las más modernas). Lee la FAQ de
www.escomposlinux.org/Faq