Hola,
Bueno, puede que si. En
http://www.pkware.com/company/standards/appnote/ parece que esta el formato zip especificado. En el se ve que el listado de contenidos esta al final del fichero. Asi que seria cuestion de coger primero ese final de fichero, donde esta el directorio. Si el servidor de donde estas descargandolo permite la descarga de rangos de bytes (si te permite resumir descarga desde cualquier punto supongo que lo permite), seria cuestion de realizar las consultas de de las zonas donde estan los datos.
Lo que ya no se es si existe ya la herramienta (para no tener que programarlo).
Saludos.