Hola jaielsaun:
Se supone que están dentro del dominio, porque si no puede haber error por acceso denegado...
Tal vez sea mejor hacer todo desde el popup, porque si habres una página e inmediatamente intentas introducir datos, puede que no se haya cargado y tengas error, pero desde el popup puedes comunicarte con el "abridor" desde opener...
<body onload="document.forms[el_form_del_textarea][el_textarea].value = opener.document.forms[el_form_del_textarea][el_textarea].value" >
...Y en el botón lo mismo pero al revés (fíjate que la única diferencia de la asignación es el opener).
Saludos