tenes que usar id diferente para cada div o usar getElementsByTagName('div'), y ahi si los llamas por el indice.
yo haría asi:
document.getElementById('prueba2').style.visibilit y='visible'
<div id="prueba1" class="oculto">0</div>
<div id="prueba2" class="oculto">1</div> <<< deberia mostrar este
<div id="prueba3" class="oculto">2</div>
<div id="prueba4" class="oculto">3</div>